Malayalam literally has the most letters:

ഋ (rarely used)
ஒள
അംஅம்
അഃஅஃ
க (aspirated)
ga
ga (aspirated)
ச்
ச் (aspirated)
ஜ (aspirated)
ட (aspirated)
ḍa
ḍa (aspirated)
த (aspirated)
da
da (aspirated)
ந / ன
ഩ (not used anymore)
ஃப
ba
ba (aspirated)
ள்
ன்
ற்
ல்
ண்
ൿ (not used anymore)க்
ൔ (not used anymore)ம்
ൕ (not used anymore)ய்
ൖ (not used anymore)ழ்
ക്കக்க
ഗ്ഗg + ga
ങ്ങங்ங
ച്ചச்ச
ച്ഛச் +ச் (aspirated)
ജ്ജஜ்ஜ
ഞ്ഞஞ்ஞ
ട്ടட்ட
ഡ്ഡḍ + ḍa
ഡ്ഢḍa + ḍa (aspirated)
ണ്ണண்ண
ത്തத்த
ത്ഥத் + த (aspirated)
ദ്ദd + da
ദ്ധd + da (aspirated)
ന്നந்ந / ன்ன
പ്പப்ப
ബ്ബb + ba
മ്മம்ம
യ്യய்ய
ല്ലல்ல
വ്വவ்வ
ശ്ശஶ்ஶ
സ്സஸ்ஸ
ള്ളள்ள
റ്റT + Ta (t in train)
ങ്കங்க
ഞ്ചஞ்ச்
ഞ്ജஞ்ஜ
ജ്ഞஜ்ஞ
ണ്ടண்ட
ണ്മண்ம
ണ്ഡண் + ḍa
ക്തக்த
ത്ഭத் + ba (aspirated)
ത്മத்ம
ത്സத்ஸ
സ്ഥஸ் + த (aspirated)
ൻ്റன் + T (t in hat)
സ്റ്റஸ் + T (t in hat)
മ്പம்ப
ഗ്നg + ன
ഗ്ദg + da
ഗ്മg + ம
ന്തந்த
ന്ഥந் + த (aspirated)
ന്ദந் + da
ന്ധந் + da (aspirated)
ന്മன்ம
ഹ്മஹ்ம
ഹ്നஹ்ன
ശ്ചஶ்ச்
ക്ഷக்ஷ
ശ്രീஸ்ரீ
ഓം
കാகா
കിகி
കീகீ
കുகு
കൂகூ
കെகெ
കേகே
കൈகை
കൊகொ
കോகோ
കൗகௌ
കംகம்
കഃகஃ
കംകகங்க
ക്ലக்ல / க்ள
ക്ര / കൃக்ர
ക്യக்ய
ക്വக்வ
ക്kŭ / க்